Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfwd2Q9R1A8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rfwd2Q9R1A8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfwd2Q9R1A8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfwd2Q9R1A8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfwd2Q9R1A8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rfwd2Q9R1A8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfwd2Q9R1A8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rfwd2Q9R1A8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfwd2Q9R1A8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfwd2Q9R1A8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rfwd2Q9R1A8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rfwd2Q9R1A8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfwd2Q9R1A8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rfwd2Q9R1A8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfwd2Q9R1A8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfwd2Q9R1A8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfwd2Q9R1A8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfwd2Q9R1A8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfwd2Q9R1A8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfwd2Q9R1A8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfwd2Q9R1A8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfwd2Q9R1A8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rfwd2Q9R1A8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rfwd2Q9R1A8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfwd2Q9R1A8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfwd2Q9R1A8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfwd2Q9R1A8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rfwd2Q9R1A8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rfwd2Q9R1A8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfwd2Q9R1A8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rfwd2Q9R1A8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfwd2Q9R1A8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rfwd2Q9R1A8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfwd2Q9R1A8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfwd2Q9R1A8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rfwd2Q9R1A8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfwd2Q9R1A8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfwd2Q9R1A8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfwd2Q9R1A8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rfwd2Q9R1A8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfwd2Q9R1A8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rfwd2Q9R1A8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rfwd2Q9R1A8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfwd2Q9R1A8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfwd2Q9R1A8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rfwd2Q9R1A8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rfwd2Q9R1A8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms