Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt6Q9R0N8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Syt6Q9R0N8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syt6Q9R0N8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syt6Q9R0N8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syt6Q9R0N8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syt6Q9R0N8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms