Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M4

Podxl, Podocalyxin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PodxlQ9R0M4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PodxlQ9R0M4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PodxlQ9R0M4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PodxlQ9R0M4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PodxlQ9R0M4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PodxlQ9R0M4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PodxlQ9R0M4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PodxlQ9R0M4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PodxlQ9R0M4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PodxlQ9R0M4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PodxlQ9R0M4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PodxlQ9R0M4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PodxlQ9R0M4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PodxlQ9R0M4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PodxlQ9R0M4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PodxlQ9R0M4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PodxlQ9R0M4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PodxlQ9R0M4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PodxlQ9R0M4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PodxlQ9R0M4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PodxlQ9R0M4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PodxlQ9R0M4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PodxlQ9R0M4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PodxlQ9R0M4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PodxlQ9R0M4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PodxlQ9R0M4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PodxlQ9R0M4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PodxlQ9R0M4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PodxlQ9R0M4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PodxlQ9R0M4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PodxlQ9R0M4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PodxlQ9R0M4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PodxlQ9R0M4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PodxlQ9R0M4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PodxlQ9R0M4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PodxlQ9R0M4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PodxlQ9R0M4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PodxlQ9R0M4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PodxlQ9R0M4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PodxlQ9R0M4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PodxlQ9R0M4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PodxlQ9R0M4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PodxlQ9R0M4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PodxlQ9R0M4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PodxlQ9R0M4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PodxlQ9R0M4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PodxlQ9R0M4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PodxlQ9R0M4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PodxlQ9R0M4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PodxlQ9R0M4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PodxlQ9R0M4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PodxlQ9R0M4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PodxlQ9R0M4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PodxlQ9R0M4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms