Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt71Q9R0H5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt71Q9R0H5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt71Q9R0H5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt71Q9R0H5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt71Q9R0H5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt71Q9R0H5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt71Q9R0H5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krt71Q9R0H5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt71Q9R0H5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krt71Q9R0H5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krt71Q9R0H5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt71Q9R0H5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krt71Q9R0H5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt71Q9R0H5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt71Q9R0H5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krt71Q9R0H5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt71Q9R0H5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt71Q9R0H5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krt71Q9R0H5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt71Q9R0H5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt71Q9R0H5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krt71Q9R0H5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt71Q9R0H5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt71Q9R0H5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krt71Q9R0H5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt71Q9R0H5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt71Q9R0H5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt71Q9R0H5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt71Q9R0H5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt71Q9R0H5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt71Q9R0H5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt71Q9R0H5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt71Q9R0H5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt71Q9R0H5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt71Q9R0H5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt71Q9R0H5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt71Q9R0H5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt71Q9R0H5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt71Q9R0H5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt71Q9R0H5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt71Q9R0H5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt71Q9R0H5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt71Q9R0H5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt71Q9R0H5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt71Q9R0H5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt71Q9R0H5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms