Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM8

Cenph, Centromere protein H, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenphQ9QYM8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CenphQ9QYM8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CenphQ9QYM8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CenphQ9QYM8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CenphQ9QYM8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CenphQ9QYM8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CenphQ9QYM8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CenphQ9QYM8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CenphQ9QYM8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CenphQ9QYM8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CenphQ9QYM8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenphQ9QYM8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenphQ9QYM8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CenphQ9QYM8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenphQ9QYM8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CenphQ9QYM8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenphQ9QYM8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenphQ9QYM8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenphQ9QYM8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenphQ9QYM8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CenphQ9QYM8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenphQ9QYM8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CenphQ9QYM8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CenphQ9QYM8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CenphQ9QYM8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CenphQ9QYM8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenphQ9QYM8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CenphQ9QYM8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenphQ9QYM8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenphQ9QYM8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CenphQ9QYM8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CenphQ9QYM8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CenphQ9QYM8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CenphQ9QYM8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms