Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK8

Nmu, Neuromedin-U, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmuQ9QXK8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NmuQ9QXK8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NmuQ9QXK8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NmuQ9QXK8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NmuQ9QXK8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NmuQ9QXK8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NmuQ9QXK8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NmuQ9QXK8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NmuQ9QXK8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NmuQ9QXK8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NmuQ9QXK8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NmuQ9QXK8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NmuQ9QXK8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NmuQ9QXK8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NmuQ9QXK8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NmuQ9QXK8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NmuQ9QXK8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NmuQ9QXK8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NmuQ9QXK8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NmuQ9QXK8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NmuQ9QXK8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NmuQ9QXK8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NmuQ9QXK8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NmuQ9QXK8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NmuQ9QXK8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NmuQ9QXK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NmuQ9QXK8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NmuQ9QXK8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NmuQ9QXK8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms