Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PdcQ9QW08 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PdcQ9QW08 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PdcQ9QW08 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PdcQ9QW08 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PdcQ9QW08 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PdcQ9QW08 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PdcQ9QW08 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PdcQ9QW08 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PdcQ9QW08 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PdcQ9QW08 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PdcQ9QW08 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PdcQ9QW08 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PdcQ9QW08 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PdcQ9QW08 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PdcQ9QW08 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PdcQ9QW08 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PdcQ9QW08 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PdcQ9QW08 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PdcQ9QW08 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PdcQ9QW08 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PdcQ9QW08 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PdcQ9QW08 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PdcQ9QW08 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PdcQ9QW08 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PdcQ9QW08 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PdcQ9QW08 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PdcQ9QW08 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PdcQ9QW08 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PdcQ9QW08 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PdcQ9QW08 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PdcQ9QW08 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PdcQ9QW08 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PdcQ9QW08 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PdcQ9QW08 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PdcQ9QW08 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms