Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccr10Q9JL21 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccr10Q9JL21 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccr10Q9JL21 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccr10Q9JL21 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccr10Q9JL21 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccr10Q9JL21 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccr10Q9JL21 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccr10Q9JL21 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccr10Q9JL21 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccr10Q9JL21 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccr10Q9JL21 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccr10Q9JL21 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccr10Q9JL21 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccr10Q9JL21 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccr10Q9JL21 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccr10Q9JL21 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccr10Q9JL21 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccr10Q9JL21 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccr10Q9JL21 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms