Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpa33Q9JKA5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gpa33Q9JKA5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gpa33Q9JKA5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gpa33Q9JKA5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpa33Q9JKA5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpa33Q9JKA5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms