Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET78

Jph2, Junctophilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph2Q9ET78 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Jph2Q9ET78 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Jph2Q9ET78 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Jph2Q9ET78 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Jph2Q9ET78 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Jph2Q9ET78 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Jph2Q9ET78 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Jph2Q9ET78 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Jph2Q9ET78 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Jph2Q9ET78 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Jph2Q9ET78 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Jph2Q9ET78 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Jph2Q9ET78 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Jph2Q9ET78 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Jph2Q9ET78 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Jph2Q9ET78 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Jph2Q9ET78 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms