Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG2

Strn3, Striatin-3, mousemouse

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Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn3Q9ERG2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Strn3Q9ERG2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Strn3Q9ERG2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Strn3Q9ERG2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Strn3Q9ERG2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Strn3Q9ERG2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Strn3Q9ERG2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Strn3Q9ERG2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Strn3Q9ERG2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Strn3Q9ERG2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strn3Q9ERG2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Strn3Q9ERG2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Strn3Q9ERG2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Strn3Q9ERG2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Strn3Q9ERG2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strn3Q9ERG2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strn3Q9ERG2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Strn3Q9ERG2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Strn3Q9ERG2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strn3Q9ERG2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strn3Q9ERG2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strn3Q9ERG2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strn3Q9ERG2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strn3Q9ERG2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strn3Q9ERG2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strn3Q9ERG2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Strn3Q9ERG2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Strn3Q9ERG2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Strn3Q9ERG2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Strn3Q9ERG2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Strn3Q9ERG2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strn3Q9ERG2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strn3Q9ERG2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strn3Q9ERG2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strn3Q9ERG2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strn3Q9ERG2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Strn3Q9ERG2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Strn3Q9ERG2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Strn3Q9ERG2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn3Q9ERG2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn3Q9ERG2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn3Q9ERG2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strn3Q9ERG2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Strn3Q9ERG2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Strn3Q9ERG2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Strn3Q9ERG2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Strn3Q9ERG2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Strn3Q9ERG2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Strn3Q9ERG2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Strn3Q9ERG2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Strn3Q9ERG2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Strn3Q9ERG2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Strn3Q9ERG2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Strn3Q9ERG2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Strn3Q9ERG2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Strn3Q9ERG2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Strn3Q9ERG2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Strn3Q9ERG2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Strn3Q9ERG2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Strn3Q9ERG2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Strn3Q9ERG2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Strn3Q9ERG2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Strn3Q9ERG2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Strn3Q9ERG2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Strn3Q9ERG2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Strn3Q9ERG2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Strn3Q9ERG2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Strn3Q9ERG2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Strn3Q9ERG2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Strn3Q9ERG2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn3Q9ERG2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Strn3Q9ERG2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Strn3Q9ERG2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Strn3Q9ERG2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Strn3Q9ERG2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Strn3Q9ERG2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Strn3Q9ERG2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Strn3Q9ERG2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Strn3Q9ERG2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms