Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH3

Vps35, Vacuolar protein sorting-associated protein 35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps35Q9EQH3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps35Q9EQH3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps35Q9EQH3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps35Q9EQH3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vps35Q9EQH3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps35Q9EQH3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps35Q9EQH3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps35Q9EQH3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps35Q9EQH3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps35Q9EQH3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps35Q9EQH3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps35Q9EQH3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps35Q9EQH3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps35Q9EQH3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps35Q9EQH3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps35Q9EQH3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps35Q9EQH3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps35Q9EQH3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps35Q9EQH3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps35Q9EQH3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps35Q9EQH3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.8 ms