Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Arfgap1Q9EPJ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Arfgap1Q9EPJ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Arfgap1Q9EPJ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgap1Q9EPJ9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfgap1Q9EPJ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfgap1Q9EPJ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfgap1Q9EPJ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfgap1Q9EPJ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfgap1Q9EPJ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfgap1Q9EPJ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfgap1Q9EPJ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgap1Q9EPJ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgap1Q9EPJ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfgap1Q9EPJ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfgap1Q9EPJ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arfgap1Q9EPJ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arfgap1Q9EPJ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms