Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCF9

Ssr3, Translocon-associated protein subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr3Q9DCF9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssr3Q9DCF9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssr3Q9DCF9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssr3Q9DCF9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssr3Q9DCF9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssr3Q9DCF9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssr3Q9DCF9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssr3Q9DCF9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssr3Q9DCF9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssr3Q9DCF9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssr3Q9DCF9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssr3Q9DCF9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssr3Q9DCF9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssr3Q9DCF9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssr3Q9DCF9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssr3Q9DCF9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssr3Q9DCF9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssr3Q9DCF9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssr3Q9DCF9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssr3Q9DCF9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ssr3Q9DCF9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ssr3Q9DCF9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ssr3Q9DCF9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssr3Q9DCF9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ssr3Q9DCF9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssr3Q9DCF9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssr3Q9DCF9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssr3Q9DCF9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ssr3Q9DCF9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssr3Q9DCF9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ssr3Q9DCF9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ssr3Q9DCF9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ssr3Q9DCF9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ssr3Q9DCF9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ssr3Q9DCF9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssr3Q9DCF9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssr3Q9DCF9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssr3Q9DCF9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssr3Q9DCF9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ssr3Q9DCF9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssr3Q9DCF9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssr3Q9DCF9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ssr3Q9DCF9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms