Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrmuQ9DAT5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrmuQ9DAT5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrmuQ9DAT5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TrmuQ9DAT5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrmuQ9DAT5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrmuQ9DAT5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrmuQ9DAT5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrmuQ9DAT5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrmuQ9DAT5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrmuQ9DAT5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrmuQ9DAT5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrmuQ9DAT5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrmuQ9DAT5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrmuQ9DAT5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrmuQ9DAT5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrmuQ9DAT5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrmuQ9DAT5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrmuQ9DAT5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrmuQ9DAT5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrmuQ9DAT5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TrmuQ9DAT5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrmuQ9DAT5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrmuQ9DAT5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrmuQ9DAT5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrmuQ9DAT5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrmuQ9DAT5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrmuQ9DAT5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrmuQ9DAT5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrmuQ9DAT5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrmuQ9DAT5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrmuQ9DAT5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrmuQ9DAT5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TrmuQ9DAT5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms