Protein–RNA interactions for Protein: Q9D880

Timm50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm50Q9D880 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timm50Q9D880 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timm50Q9D880 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Timm50Q9D880 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timm50Q9D880 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timm50Q9D880 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timm50Q9D880 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timm50Q9D880 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timm50Q9D880 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm50Q9D880 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm50Q9D880 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timm50Q9D880 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timm50Q9D880 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Timm50Q9D880 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timm50Q9D880 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timm50Q9D880 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timm50Q9D880 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timm50Q9D880 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timm50Q9D880 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm50Q9D880 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm50Q9D880 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm50Q9D880 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm50Q9D880 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timm50Q9D880 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timm50Q9D880 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timm50Q9D880 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timm50Q9D880 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timm50Q9D880 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm50Q9D880 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timm50Q9D880 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timm50Q9D880 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timm50Q9D880 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timm50Q9D880 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timm50Q9D880 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timm50Q9D880 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timm50Q9D880 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Timm50Q9D880 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Timm50Q9D880 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timm50Q9D880 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timm50Q9D880 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timm50Q9D880 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Timm50Q9D880 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Timm50Q9D880 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timm50Q9D880 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Timm50Q9D880 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Timm50Q9D880 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Timm50Q9D880 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Timm50Q9D880 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Timm50Q9D880 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Timm50Q9D880 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Timm50Q9D880 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timm50Q9D880 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timm50Q9D880 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timm50Q9D880 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timm50Q9D880 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Timm50Q9D880 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Timm50Q9D880 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Timm50Q9D880 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Timm50Q9D880 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm50Q9D880 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm50Q9D880 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm50Q9D880 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.9 ms