Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fip1l1Q9D824 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fip1l1Q9D824 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fip1l1Q9D824 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fip1l1Q9D824 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fip1l1Q9D824 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fip1l1Q9D824 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fip1l1Q9D824 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fip1l1Q9D824 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fip1l1Q9D824 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fip1l1Q9D824 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fip1l1Q9D824 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fip1l1Q9D824 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fip1l1Q9D824 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fip1l1Q9D824 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fip1l1Q9D824 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fip1l1Q9D824 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fip1l1Q9D824 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fip1l1Q9D824 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fip1l1Q9D824 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fip1l1Q9D824 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fip1l1Q9D824 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fip1l1Q9D824 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fip1l1Q9D824 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fip1l1Q9D824 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fip1l1Q9D824 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fip1l1Q9D824 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fip1l1Q9D824 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fip1l1Q9D824 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fip1l1Q9D824 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fip1l1Q9D824 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fip1l1Q9D824 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fip1l1Q9D824 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fip1l1Q9D824 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms