Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chmp5Q9D7S9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Chmp5Q9D7S9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Chmp5Q9D7S9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Chmp5Q9D7S9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Chmp5Q9D7S9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Chmp5Q9D7S9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chmp5Q9D7S9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp5Q9D7S9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Chmp5Q9D7S9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Chmp5Q9D7S9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Chmp5Q9D7S9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Chmp5Q9D7S9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Chmp5Q9D7S9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Chmp5Q9D7S9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Chmp5Q9D7S9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Chmp5Q9D7S9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Chmp5Q9D7S9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Chmp5Q9D7S9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Chmp5Q9D7S9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Chmp5Q9D7S9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Chmp5Q9D7S9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Chmp5Q9D7S9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Chmp5Q9D7S9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Chmp5Q9D7S9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Chmp5Q9D7S9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Chmp5Q9D7S9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Chmp5Q9D7S9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chmp5Q9D7S9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Chmp5Q9D7S9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Chmp5Q9D7S9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Chmp5Q9D7S9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Chmp5Q9D7S9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Chmp5Q9D7S9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chmp5Q9D7S9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chmp5Q9D7S9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Chmp5Q9D7S9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chmp5Q9D7S9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Chmp5Q9D7S9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Chmp5Q9D7S9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Chmp5Q9D7S9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Chmp5Q9D7S9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms