Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc94Q9D6J3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc94Q9D6J3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc94Q9D6J3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc94Q9D6J3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc94Q9D6J3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc94Q9D6J3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc94Q9D6J3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc94Q9D6J3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc94Q9D6J3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc94Q9D6J3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc94Q9D6J3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc94Q9D6J3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc94Q9D6J3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc94Q9D6J3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc94Q9D6J3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc94Q9D6J3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc94Q9D6J3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc94Q9D6J3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc94Q9D6J3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc94Q9D6J3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc94Q9D6J3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc94Q9D6J3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc94Q9D6J3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc94Q9D6J3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc94Q9D6J3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc94Q9D6J3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc94Q9D6J3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc94Q9D6J3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc94Q9D6J3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc94Q9D6J3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc94Q9D6J3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc94Q9D6J3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc94Q9D6J3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc94Q9D6J3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc94Q9D6J3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc94Q9D6J3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc94Q9D6J3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms