Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec23bQ9D662 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec23bQ9D662 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec23bQ9D662 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec23bQ9D662 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec23bQ9D662 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sec23bQ9D662 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sec23bQ9D662 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sec23bQ9D662 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sec23bQ9D662 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms