Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D4W2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9D4W2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9D4W2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9D4W2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D4W2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D4W2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D4W2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D4W2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D4W2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D4W2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D4W2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D4W2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D4W2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D4W2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D4W2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D4W2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D4W2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D4W2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D4W2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D4W2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D4W2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D4W2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Q9D4W2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D4W2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9D4W2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D4W2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D4W2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms