Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D3J9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D3J9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9D3J9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D3J9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D3J9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D3J9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D3J9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9D3J9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9D3J9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9D3J9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D3J9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D3J9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D3J9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9D3J9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D3J9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D3J9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D3J9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9D3J9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D3J9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9D3J9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9D3J9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q9D3J9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q9D3J9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D3J9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q9D3J9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D3J9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9D3J9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D3J9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9D3J9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D3J9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D3J9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D3J9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D3J9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D3J9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D3J9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D3J9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D3J9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D3J9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D3J9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D3J9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D3J9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D3J9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D3J9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D3J9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D3J9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D3J9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D3J9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D3J9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D3J9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms