Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bcas2Q9D287 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcas2Q9D287 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcas2Q9D287 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcas2Q9D287 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcas2Q9D287 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcas2Q9D287 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcas2Q9D287 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcas2Q9D287 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcas2Q9D287 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bcas2Q9D287 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcas2Q9D287 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Bcas2Q9D287 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcas2Q9D287 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Bcas2Q9D287 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Bcas2Q9D287 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Bcas2Q9D287 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcas2Q9D287 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcas2Q9D287 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcas2Q9D287 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Bcas2Q9D287 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcas2Q9D287 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcas2Q9D287 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Bcas2Q9D287 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Bcas2Q9D287 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcas2Q9D287 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcas2Q9D287 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcas2Q9D287 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms