Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SarnpQ9D1J3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SarnpQ9D1J3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SarnpQ9D1J3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SarnpQ9D1J3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SarnpQ9D1J3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SarnpQ9D1J3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SarnpQ9D1J3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SarnpQ9D1J3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SarnpQ9D1J3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SarnpQ9D1J3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SarnpQ9D1J3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SarnpQ9D1J3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SarnpQ9D1J3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SarnpQ9D1J3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms