Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl52Q9D0Y8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mrpl52Q9D0Y8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl52Q9D0Y8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl52Q9D0Y8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl52Q9D0Y8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms