Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdca7Q9D0M2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdca7Q9D0M2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdca7Q9D0M2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cdca7Q9D0M2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cdca7Q9D0M2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cdca7Q9D0M2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cdca7Q9D0M2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdca7Q9D0M2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cdca7Q9D0M2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Cdca7Q9D0M2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdca7Q9D0M2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cdca7Q9D0M2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdca7Q9D0M2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cdca7Q9D0M2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdca7Q9D0M2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cdca7Q9D0M2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdca7Q9D0M2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdca7Q9D0M2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cdca7Q9D0M2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cdca7Q9D0M2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cdca7Q9D0M2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdca7Q9D0M2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdca7Q9D0M2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdca7Q9D0M2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cdca7Q9D0M2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cdca7Q9D0M2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Cdca7Q9D0M2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdca7Q9D0M2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdca7Q9D0M2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdca7Q9D0M2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdca7Q9D0M2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdca7Q9D0M2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdca7Q9D0M2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdca7Q9D0M2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdca7Q9D0M2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdca7Q9D0M2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdca7Q9D0M2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdca7Q9D0M2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdca7Q9D0M2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdca7Q9D0M2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdca7Q9D0M2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdca7Q9D0M2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdca7Q9D0M2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdca7Q9D0M2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cdca7Q9D0M2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms