Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZS3

Fopnl, LisH domain-containing protein FOPNL, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FopnlQ9CZS3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FopnlQ9CZS3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FopnlQ9CZS3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FopnlQ9CZS3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FopnlQ9CZS3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FopnlQ9CZS3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FopnlQ9CZS3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FopnlQ9CZS3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FopnlQ9CZS3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FopnlQ9CZS3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FopnlQ9CZS3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FopnlQ9CZS3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FopnlQ9CZS3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FopnlQ9CZS3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FopnlQ9CZS3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FopnlQ9CZS3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FopnlQ9CZS3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FopnlQ9CZS3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FopnlQ9CZS3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FopnlQ9CZS3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FopnlQ9CZS3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FopnlQ9CZS3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FopnlQ9CZS3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FopnlQ9CZS3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FopnlQ9CZS3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FopnlQ9CZS3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FopnlQ9CZS3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FopnlQ9CZS3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FopnlQ9CZS3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FopnlQ9CZS3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FopnlQ9CZS3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FopnlQ9CZS3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FopnlQ9CZS3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FopnlQ9CZS3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FopnlQ9CZS3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FopnlQ9CZS3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FopnlQ9CZS3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FopnlQ9CZS3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FopnlQ9CZS3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FopnlQ9CZS3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FopnlQ9CZS3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FopnlQ9CZS3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FopnlQ9CZS3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FopnlQ9CZS3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FopnlQ9CZS3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms