Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZP0

Ufsp1, Ufm1-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp1Q9CZP0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ufsp1Q9CZP0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ufsp1Q9CZP0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ufsp1Q9CZP0 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ufsp1Q9CZP0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.1 ms