Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc77Q9CZH8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc77Q9CZH8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc77Q9CZH8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc77Q9CZH8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc77Q9CZH8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc77Q9CZH8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc77Q9CZH8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc77Q9CZH8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc77Q9CZH8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc77Q9CZH8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc77Q9CZH8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc77Q9CZH8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc77Q9CZH8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc77Q9CZH8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc77Q9CZH8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc77Q9CZH8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc77Q9CZH8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc77Q9CZH8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms