Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
3110001I22RikQ9CZ70 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
3110001I22RikQ9CZ70 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
3110001I22RikQ9CZ70 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
3110001I22RikQ9CZ70 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
3110001I22RikQ9CZ70 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
3110001I22RikQ9CZ70 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
3110001I22RikQ9CZ70 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
3110001I22RikQ9CZ70 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
3110001I22RikQ9CZ70 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.2 ms