Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cmtm6Q9CZ69 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmtm6Q9CZ69 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm6Q9CZ69 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtm6Q9CZ69 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmtm6Q9CZ69 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmtm6Q9CZ69 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmtm6Q9CZ69 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtm6Q9CZ69 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtm6Q9CZ69 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtm6Q9CZ69 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmtm6Q9CZ69 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmtm6Q9CZ69 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm6Q9CZ69 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm6Q9CZ69 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm6Q9CZ69 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cmtm6Q9CZ69 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmtm6Q9CZ69 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmtm6Q9CZ69 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cmtm6Q9CZ69 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm6Q9CZ69 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms