Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
2310003L06RikQ9CV82 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
2310003L06RikQ9CV82 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
2310003L06RikQ9CV82 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
2310003L06RikQ9CV82 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
2310003L06RikQ9CV82 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
2310003L06RikQ9CV82 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
2310003L06RikQ9CV82 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
2310003L06RikQ9CV82 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
2310003L06RikQ9CV82 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
2310003L06RikQ9CV82 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
2310003L06RikQ9CV82 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
2310003L06RikQ9CV82 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
2310003L06RikQ9CV82 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
2310003L06RikQ9CV82 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
2310003L06RikQ9CV82 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
2310003L06RikQ9CV82 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
2310003L06RikQ9CV82 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2310003L06RikQ9CV82 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2310003L06RikQ9CV82 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
2310003L06RikQ9CV82 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
2310003L06RikQ9CV82 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
2310003L06RikQ9CV82 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
2310003L06RikQ9CV82 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
2310003L06RikQ9CV82 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
2310003L06RikQ9CV82 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
2310003L06RikQ9CV82 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms