Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp13a2Q9CTG6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp13a2Q9CTG6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a2Q9CTG6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a2Q9CTG6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp13a2Q9CTG6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a2Q9CTG6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp13a2Q9CTG6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp13a2Q9CTG6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp13a2Q9CTG6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp13a2Q9CTG6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp13a2Q9CTG6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a2Q9CTG6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a2Q9CTG6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp13a2Q9CTG6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp13a2Q9CTG6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp13a2Q9CTG6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a2Q9CTG6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp13a2Q9CTG6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a2Q9CTG6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a2Q9CTG6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a2Q9CTG6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp13a2Q9CTG6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a2Q9CTG6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp13a2Q9CTG6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp13a2Q9CTG6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp13a2Q9CTG6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp13a2Q9CTG6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms