Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msmo1Q9CRA4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msmo1Q9CRA4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Msmo1Q9CRA4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Msmo1Q9CRA4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Msmo1Q9CRA4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms