Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tma16Q9CR02 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tma16Q9CR02 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tma16Q9CR02 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tma16Q9CR02 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tma16Q9CR02 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tma16Q9CR02 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tma16Q9CR02 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tma16Q9CR02 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tma16Q9CR02 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tma16Q9CR02 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tma16Q9CR02 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tma16Q9CR02 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tma16Q9CR02 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tma16Q9CR02 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tma16Q9CR02 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tma16Q9CR02 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tma16Q9CR02 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tma16Q9CR02 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tma16Q9CR02 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tma16Q9CR02 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tma16Q9CR02 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tma16Q9CR02 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tma16Q9CR02 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tma16Q9CR02 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tma16Q9CR02 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tma16Q9CR02 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tma16Q9CR02 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tma16Q9CR02 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tma16Q9CR02 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tma16Q9CR02 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tma16Q9CR02 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms