Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cldnd1Q9CQX5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cldnd1Q9CQX5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldnd1Q9CQX5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldnd1Q9CQX5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cldnd1Q9CQX5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cldnd1Q9CQX5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cldnd1Q9CQX5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cldnd1Q9CQX5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cldnd1Q9CQX5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cldnd1Q9CQX5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cldnd1Q9CQX5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cldnd1Q9CQX5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cldnd1Q9CQX5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cldnd1Q9CQX5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cldnd1Q9CQX5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cldnd1Q9CQX5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cldnd1Q9CQX5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cldnd1Q9CQX5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cldnd1Q9CQX5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cldnd1Q9CQX5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cldnd1Q9CQX5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cldnd1Q9CQX5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cldnd1Q9CQX5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cldnd1Q9CQX5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldnd1Q9CQX5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cldnd1Q9CQX5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cldnd1Q9CQX5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cldnd1Q9CQX5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cldnd1Q9CQX5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cldnd1Q9CQX5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cldnd1Q9CQX5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cldnd1Q9CQX5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cldnd1Q9CQX5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cldnd1Q9CQX5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cldnd1Q9CQX5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldnd1Q9CQX5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldnd1Q9CQX5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldnd1Q9CQX5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cldnd1Q9CQX5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cldnd1Q9CQX5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cldnd1Q9CQX5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cldnd1Q9CQX5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cldnd1Q9CQX5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cldnd1Q9CQX5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cldnd1Q9CQX5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cldnd1Q9CQX5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cldnd1Q9CQX5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cldnd1Q9CQX5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cldnd1Q9CQX5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cldnd1Q9CQX5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldnd1Q9CQX5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldnd1Q9CQX5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cldnd1Q9CQX5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cldnd1Q9CQX5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cldnd1Q9CQX5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cldnd1Q9CQX5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cldnd1Q9CQX5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cldnd1Q9CQX5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cldnd1Q9CQX5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cldnd1Q9CQX5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cldnd1Q9CQX5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cldnd1Q9CQX5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cldnd1Q9CQX5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cldnd1Q9CQX5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms