Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PompQ9CQT5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PompQ9CQT5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PompQ9CQT5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PompQ9CQT5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PompQ9CQT5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PompQ9CQT5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PompQ9CQT5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PompQ9CQT5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PompQ9CQT5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PompQ9CQT5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PompQ9CQT5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PompQ9CQT5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PompQ9CQT5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PompQ9CQT5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PompQ9CQT5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PompQ9CQT5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PompQ9CQT5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PompQ9CQT5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PompQ9CQT5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PompQ9CQT5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PompQ9CQT5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PompQ9CQT5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PompQ9CQT5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PompQ9CQT5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PompQ9CQT5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PompQ9CQT5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms