Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chchd5Q9CQP3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chchd5Q9CQP3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chchd5Q9CQP3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chchd5Q9CQP3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd5Q9CQP3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chchd5Q9CQP3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms