Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl39lQ9CQD0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl39lQ9CQD0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rpl39lQ9CQD0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl39lQ9CQD0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl39lQ9CQD0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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