Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim8Q99PJ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim8Q99PJ2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim8Q99PJ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim8Q99PJ2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim8Q99PJ2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim8Q99PJ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim8Q99PJ2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim8Q99PJ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim8Q99PJ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim8Q99PJ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim8Q99PJ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim8Q99PJ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim8Q99PJ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim8Q99PJ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim8Q99PJ2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim8Q99PJ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim8Q99PJ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim8Q99PJ2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim8Q99PJ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim8Q99PJ2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim8Q99PJ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim8Q99PJ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim8Q99PJ2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim8Q99PJ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim8Q99PJ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim8Q99PJ2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms