Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tsnaxip1Q99P25 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsnaxip1Q99P25 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsnaxip1Q99P25 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsnaxip1Q99P25 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsnaxip1Q99P25 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tsnaxip1Q99P25 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsnaxip1Q99P25 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsnaxip1Q99P25 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsnaxip1Q99P25 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tsnaxip1Q99P25 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tsnaxip1Q99P25 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsnaxip1Q99P25 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsnaxip1Q99P25 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsnaxip1Q99P25 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsnaxip1Q99P25 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tsnaxip1Q99P25 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsnaxip1Q99P25 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsnaxip1Q99P25 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsnaxip1Q99P25 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsnaxip1Q99P25 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsnaxip1Q99P25 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsnaxip1Q99P25 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsnaxip1Q99P25 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tsnaxip1Q99P25 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tsnaxip1Q99P25 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsnaxip1Q99P25 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tsnaxip1Q99P25 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tsnaxip1Q99P25 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tsnaxip1Q99P25 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tsnaxip1Q99P25 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tsnaxip1Q99P25 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsnaxip1Q99P25 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsnaxip1Q99P25 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsnaxip1Q99P25 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsnaxip1Q99P25 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsnaxip1Q99P25 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tsnaxip1Q99P25 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsnaxip1Q99P25 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tsnaxip1Q99P25 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tsnaxip1Q99P25 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsnaxip1Q99P25 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsnaxip1Q99P25 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsnaxip1Q99P25 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsnaxip1Q99P25 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tsnaxip1Q99P25 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsnaxip1Q99P25 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsnaxip1Q99P25 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tsnaxip1Q99P25 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tsnaxip1Q99P25 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsnaxip1Q99P25 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tsnaxip1Q99P25 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tsnaxip1Q99P25 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tsnaxip1Q99P25 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms