Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cmtm3Q99LJ5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cmtm3Q99LJ5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cmtm3Q99LJ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cmtm3Q99LJ5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cmtm3Q99LJ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cmtm3Q99LJ5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms