Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GatbQ99JT1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GatbQ99JT1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GatbQ99JT1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GatbQ99JT1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GatbQ99JT1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GatbQ99JT1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GatbQ99JT1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GatbQ99JT1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GatbQ99JT1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GatbQ99JT1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GatbQ99JT1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GatbQ99JT1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GatbQ99JT1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GatbQ99JT1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GatbQ99JT1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GatbQ99JT1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GatbQ99JT1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GatbQ99JT1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GatbQ99JT1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms