Protein–RNA interactions for Protein: Q99JG7

Tnip2, TNFAIP3-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip2Q99JG7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnip2Q99JG7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnip2Q99JG7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnip2Q99JG7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnip2Q99JG7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip2Q99JG7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip2Q99JG7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnip2Q99JG7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnip2Q99JG7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnip2Q99JG7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnip2Q99JG7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip2Q99JG7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip2Q99JG7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip2Q99JG7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnip2Q99JG7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip2Q99JG7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnip2Q99JG7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnip2Q99JG7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnip2Q99JG7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnip2Q99JG7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnip2Q99JG7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnip2Q99JG7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnip2Q99JG7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnip2Q99JG7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnip2Q99JG7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip2Q99JG7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip2Q99JG7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip2Q99JG7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip2Q99JG7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip2Q99JG7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip2Q99JG7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnip2Q99JG7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms