Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk9Q99J95 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk9Q99J95 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk9Q99J95 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk9Q99J95 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk9Q99J95 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdk9Q99J95 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk9Q99J95 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk9Q99J95 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk9Q99J95 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk9Q99J95 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk9Q99J95 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdk9Q99J95 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk9Q99J95 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk9Q99J95 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk9Q99J95 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk9Q99J95 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdk9Q99J95 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdk9Q99J95 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdk9Q99J95 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdk9Q99J95 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms