Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Def8Q99J78 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Def8Q99J78 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Def8Q99J78 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Def8Q99J78 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Def8Q99J78 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Def8Q99J78 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Def8Q99J78 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Def8Q99J78 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Def8Q99J78 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Def8Q99J78 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Def8Q99J78 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Def8Q99J78 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Def8Q99J78 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Def8Q99J78 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Def8Q99J78 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Def8Q99J78 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Def8Q99J78 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Def8Q99J78 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Def8Q99J78 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Def8Q99J78 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Def8Q99J78 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Def8Q99J78 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Def8Q99J78 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Def8Q99J78 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Def8Q99J78 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Def8Q99J78 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Def8Q99J78 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Def8Q99J78 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Def8Q99J78 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Def8Q99J78 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Def8Q99J78 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Def8Q99J78 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Def8Q99J78 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Def8Q99J78 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Def8Q99J78 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Def8Q99J78 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Def8Q99J78 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Def8Q99J78 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Def8Q99J78 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Def8Q99J78 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Def8Q99J78 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Def8Q99J78 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Def8Q99J78 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms