Protein–RNA interactions for Protein: Q925J9

Med1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med1Q925J9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Med1Q925J9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Med1Q925J9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Med1Q925J9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Med1Q925J9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Med1Q925J9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Med1Q925J9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Med1Q925J9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Med1Q925J9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Med1Q925J9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Med1Q925J9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Med1Q925J9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Med1Q925J9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Med1Q925J9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Med1Q925J9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Med1Q925J9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Med1Q925J9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Med1Q925J9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Med1Q925J9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Med1Q925J9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Med1Q925J9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Med1Q925J9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Med1Q925J9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Med1Q925J9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Med1Q925J9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Med1Q925J9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Med1Q925J9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Med1Q925J9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Med1Q925J9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Med1Q925J9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Med1Q925J9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Med1Q925J9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Med1Q925J9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Med1Q925J9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Med1Q925J9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Med1Q925J9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Med1Q925J9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Med1Q925J9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Med1Q925J9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Med1Q925J9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Med1Q925J9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Med1Q925J9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Med1Q925J9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Med1Q925J9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Med1Q925J9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Med1Q925J9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Med1Q925J9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Med1Q925J9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Med1Q925J9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Med1Q925J9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Med1Q925J9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Med1Q925J9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Med1Q925J9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Med1Q925J9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Med1Q925J9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Med1Q925J9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Med1Q925J9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Med1Q925J9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Med1Q925J9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Med1Q925J9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Med1Q925J9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Med1Q925J9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Med1Q925J9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Med1Q925J9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Med1Q925J9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Med1Q925J9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Med1Q925J9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Med1Q925J9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Med1Q925J9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Med1Q925J9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Med1Q925J9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Med1Q925J9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Med1Q925J9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Med1Q925J9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Med1Q925J9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Med1Q925J9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Med1Q925J9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Med1Q925J9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Med1Q925J9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Med1Q925J9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms