Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn1Q922Y1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn1Q922Y1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn1Q922Y1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn1Q922Y1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn1Q922Y1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn1Q922Y1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn1Q922Y1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn1Q922Y1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn1Q922Y1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn1Q922Y1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn1Q922Y1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn1Q922Y1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn1Q922Y1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn1Q922Y1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn1Q922Y1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn1Q922Y1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn1Q922Y1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn1Q922Y1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn1Q922Y1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn1Q922Y1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn1Q922Y1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn1Q922Y1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn1Q922Y1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ubxn1Q922Y1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn1Q922Y1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn1Q922Y1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn1Q922Y1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ubxn1Q922Y1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn1Q922Y1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn1Q922Y1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn1Q922Y1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ubxn1Q922Y1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn1Q922Y1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ubxn1Q922Y1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn1Q922Y1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn1Q922Y1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn1Q922Y1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn1Q922Y1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn1Q922Y1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn1Q922Y1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn1Q922Y1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn1Q922Y1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn1Q922Y1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn1Q922Y1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn1Q922Y1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn1Q922Y1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn1Q922Y1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn1Q922Y1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn1Q922Y1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn1Q922Y1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn1Q922Y1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn1Q922Y1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn1Q922Y1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn1Q922Y1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn1Q922Y1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn1Q922Y1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn1Q922Y1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn1Q922Y1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn1Q922Y1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms