Protein–RNA interactions for Protein: Q91YU3

Msantd4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msantd4Q91YU3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Msantd4Q91YU3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Msantd4Q91YU3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Msantd4Q91YU3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Msantd4Q91YU3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Msantd4Q91YU3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msantd4Q91YU3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msantd4Q91YU3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Msantd4Q91YU3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msantd4Q91YU3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Msantd4Q91YU3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msantd4Q91YU3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msantd4Q91YU3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msantd4Q91YU3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msantd4Q91YU3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msantd4Q91YU3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msantd4Q91YU3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msantd4Q91YU3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msantd4Q91YU3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msantd4Q91YU3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msantd4Q91YU3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msantd4Q91YU3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msantd4Q91YU3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msantd4Q91YU3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Msantd4Q91YU3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Msantd4Q91YU3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Msantd4Q91YU3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Msantd4Q91YU3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Msantd4Q91YU3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Msantd4Q91YU3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msantd4Q91YU3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Msantd4Q91YU3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Msantd4Q91YU3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Msantd4Q91YU3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Msantd4Q91YU3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Msantd4Q91YU3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Msantd4Q91YU3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Msantd4Q91YU3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Msantd4Q91YU3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Msantd4Q91YU3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Msantd4Q91YU3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Msantd4Q91YU3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Msantd4Q91YU3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Msantd4Q91YU3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Msantd4Q91YU3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Msantd4Q91YU3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msantd4Q91YU3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msantd4Q91YU3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms