Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nsmce2Q91VT1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nsmce2Q91VT1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nsmce2Q91VT1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nsmce2Q91VT1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nsmce2Q91VT1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nsmce2Q91VT1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nsmce2Q91VT1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nsmce2Q91VT1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nsmce2Q91VT1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nsmce2Q91VT1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Nsmce2Q91VT1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nsmce2Q91VT1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nsmce2Q91VT1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsmce2Q91VT1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsmce2Q91VT1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsmce2Q91VT1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsmce2Q91VT1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nsmce2Q91VT1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsmce2Q91VT1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nsmce2Q91VT1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsmce2Q91VT1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nsmce2Q91VT1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nsmce2Q91VT1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsmce2Q91VT1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nsmce2Q91VT1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nsmce2Q91VT1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nsmce2Q91VT1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nsmce2Q91VT1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nsmce2Q91VT1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nsmce2Q91VT1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nsmce2Q91VT1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nsmce2Q91VT1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms